Esta es una molécula transportadora natural que acarrea los ácidos grasos hacia la mitocondria celular, para que los ácidos grasos puedan ser metabolizados o descompuestos en pedazos de acetil-CoA. La mayor parte de acetil CoA, se dirige hacia el ciclo del ácido cítrico, lo cual proporciona hidrógeno, bicarbonato, y energía para la síntesis de ATP. La L-carnitina ha sido utilizada con gran ventaja, cuando en el autismo, a nivel molecular, se involucran disfunciones mitocondriales. Los marcadores analíticos y diagnósticos para el requerimiento de carnitina incluyen bajos niveles de carnitina en sangre, altos niveles de ácidos grasos poco usuales, en orina o en sangre (atípico, subéico, octenedióico), elevados triglicéridos en sangre, miopatía y fatiga crónica. Relativamente grandes cantidades de L-carnitina son necesarias terapéuticamente, usualmente de 25 a 100 mg/kg de peso corporal, por día, en dosis divididas. Nunca utilice la D,L-carnitina. La forma D- de hecho inhibe la función de la carnitina. Por lo general, la carnitina es vendida en una forma estabilizada pero altamente bioaccesible, la acetil-L-carnitina, la cual está bien para usarse en el autismo. Este suplemento puede ser intentado en cualquier momento durante el curso de las intervenciones biomédicas, inclusive en las fases tempranas, pero trabaja mejor después de la intervención en la dieta y en la resolución de los aspectos gastrointestinales.
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